2'-F-dU Phosphoramidit

2'-F-dU Phosphoramidit baut 2′-Fluor-2′-desoxyuridin in synthetische Oligonukleotide ein. Die 2′-Fluor-Modifikation erhöht die thermische Stabilität von Duplexen, die mit komplementärer RNA gebildet werden (ΔTm ≈ +2–3 °C pro Modifikation), im Vergleich zu DNA oder sogar 2′-O-Methyl-RNA dramatisch und verleiht gleichzeitig eine außergewöhnliche Beständigkeit gegen Nukleaseabbau. 2'-F-dU-Phosphoramidit ist besonders wertvoll beim siRNA-Design, wo 2′-F-Modifikationen im Sense-Strang Off-Target-Effekte reduzieren und die Stoffwechselstabilität verbessern können, ohne die RNAi-Aktivität zu beeinträchtigen. 2'-F-dU-Phosphoramidit wird auch bei der Aptamerentwicklung verwendet, da die 2′-F-Modifikation die chemische Vielfalt von Aptamerbibliotheken erweitert und die In-vivo-Halbwertszeit verbessert. Die Uridinbase benötigt keine exozyklische Amin-Schutzgruppe (im Gegensatz zu C, A oder G), wodurch sich die Schutzgruppe von 2'-F-dU-Phosphoramidit einfacher entschützen lässt – standardmäßige konzentrierte Ammoniak- oder AMA-Behandlung entfernt die Cyanoethylgruppe und spaltet das Oligonukleotid vom Träger ab, ohne dass zusätzliche Schritte zur Basenentschützung erforderlich sind. 2'-F-dU Phosphoramidit ist vollständig kompatibel mit Standard-DNA/RNA-Synthesizern, allerdings müssen die Kopplungszeiten aufgrund der elektronenziehenden Wirkung des Fluoratoms möglicherweise verlängert werden (6–10 Minuten).

Produktparameter

Warum Cosperpharm? – Unsere Wettbewerbsvorteile

Synthetischer Weg

Unter Argonschutz wurde 5'-O-(4,4'-Dimethoxytriphenylmethyl)-2'-desoxy-2'-fluoruridin (3,00 g, 5,47 mmol) in wasserfreiem Dichlormethan (50 ml) gelöst. N,N-Diisopropylethylamin (0,55 ml, 3,18 mmol), 1H-Tetrazol (0,45 g, 6,45 mmol) und Bis(2-cyanethylamino)(2-cyanoethoxy)phosphin (1,92 g, 6,36 mmol) wurden nacheinander zugegeben. Die Reaktionsmischung wurde über Nacht bei Raumtemperatur gerührt. Nach Bestätigung des Abschlusses durch TLC wurde eine 5 %ige wässrige Natriumbicarbonatlösung (20 ml) zugegeben, um die Schichten zu trennen; Die organische Schicht wurde mit gesättigter Kochsalzlösung (20 ml) gewaschen. Nach dem Trocknen mit wasserfreiem Natriumsulfat wurde die organische Schicht unter vermindertem Druck eingeengt. Das Rohprodukt wurde durch Kieselgel-Säulenchromatographie unter Verwendung einer Hexan/Ethylacetat-Mischung mit 3 % Triethylamin (75:25 bis 30:70, Vol./Vol.) gereinigt. Die das Zielprodukt enthaltende Fraktion wurde gesammelt und unter vermindertem Druck konzentriert, was (2R,3R,4R,5R)-2-(bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-4-fluor-4-hydroxytetrahydrofuran-3-yl(2-cyanethyl)disoisoprophosphamid (2,76 g, Ausbeute) ergab 67,3 %).

Qualitätssicherung bei Cosperpharm

Jede Charge durchläuft:

● Gaschromatographie (GC) – Reinheit ≥97,0 %

● Nichtwässrige Titration – Reinheit ≥97,0 %

● Brechungsindex – Bestätigungsanalyse

● ¹H-NMR – Strukturverifizierung

● Aussehen – farblose bis hellgelbe bis hellorange klare Flüssigkeit

Ein umfassendes Echtheitszertifikat, ein Sicherheitsdatenblatt (mit vollständigen GHS-Informationen) und ein Ursprungszeugnis liegen jeder Sendung bei.

Kontaktieren Sie uns

Benötigen Sie eine zuverlässige Quelle für 2'-F-dU-Phosphoramidit für Ihr Oligonukleotid-Syntheseprogramm? Cosperpharm bietet hochreines Monomer, vollständige analytische Dokumentation und fachkundige technische Unterstützung von der Forschung bis zum kommerziellen Maßstab. Kontaktieren Sie uns noch heute.