5'-O-(4,4'-DiMethoxytrityl)-N4-benzoyl-2'-desoxy-5-Methylcytidin-3'-O-(O-2-cyanoethyl-N,N-diisopropylaMino) phosphoraMidit

5'-O-(4,4'-DiMethoxytrityl)-N4-benzoyl-2'-desoxy-5-Methylcytidin-3'-O-(O-2-cyanoethyl-N,N-diisopropylaMino) phosphoramidit ist das Standardmonomer für die Einführung von 5-Methyl-2′-desoxycytidinresten in synthetische DNA und Antisense-Oligonukleotide. Die N4-Benzoylgruppe schützt das exocyclische Amin der Cytosinbase und verhindert so Verzweigungsreaktionen während der Festphasensynthese. Die 5-Methylgruppe am Cytosinring erhöht die thermische Stabilität von Duplexen, die mit komplementärer DNA oder RNA gebildet werden (ΔTm ≈ +0,5–1,0 °C pro Modifikation) und verringert vor allem das immunstimulierende Potenzial von CpG-Motiven bei Verwendung in Antisense- oder CpG-basierten Impfstoffen. 5'-O-(4,4'-DiMethoxytrityl)-N4-benzoyl-2'-desoxy-5-Methylcytidin-3'-O-(O-2-cyanoethyl-N,N-diisopropylaMino) phosphoramidit ist vollständig kompatibel mit Standard-DNA-Synthesezyklen (Kopplungszeit 2–3 Minuten, Aktivator wie Tetrazol oder DCI) und Standard-Entschützungsbedingungen (konzentriert). NH₃, 55°C, 8–16 h). 5'-O-(4,4'-DiMethoxytrityl)-N4-benzoyl-2'-desoxy-5-Methylcytidin-3'-O-(O-2-cyanoethyl-N,N-diisopropylaMino) phosphoramidit ist in Kombination mit anderen modifizierten Monomeren auch ein Schlüsselzwischenprodukt bei der Synthese von Locked Nucleic Acid (LNA)-haltigen Oligonukleotiden. Dieses Phosphoramidit wird häufig bei der Herstellung von von der FDA zugelassenen Antisense-Medikamenten und in Forschungsanwendungen zur Erforschung der epigenetischen Regulation und DNA-Methylierungsanalyse verwendet.

Produktparameter

Qualitätssicherung bei Cosperpharm

Jede Charge durchläuft:

● Gaschromatographie (GC) – Reinheit ≥97,0 %

● Nichtwässrige Titration – Reinheit ≥97,0 %

● Brechungsindex – Bestätigungsanalyse

● ¹H-NMR – Strukturverifizierung

● Aussehen – farblose bis hellgelbe bis hellorange klare Flüssigkeit

Ein umfassendes Echtheitszertifikat, ein Sicherheitsdatenblatt (mit vollständigen GHS-Informationen) und ein Ursprungszeugnis liegen jeder Sendung bei.

Lagerbedingungen

Lagern Sie 5'-O-(4,4'-DiMethoxytrityl)-N4-benzoyl-2'-desoxy-5-Methylcytidin-3'-O-(O-2-cyanoethyl-N,N-diisopropylaMino) phosphoramidit in einem dicht verschlossenen Behälter unter Inertatmosphäre (Stickstoff oder Argon) bei –20 °C zur Langzeitlagerung. Eine kurzfristige Lagerung (bis zu 3 Monate) bei 2–8 °C unter Austrocknung kann akzeptabel sein, wird jedoch nicht für längere Zeiträume empfohlen. Bewahren Sie den Behälter trocken, vor Licht geschützt und fern von starken Oxidationsmitteln und Säuren auf. Die Masse ist sehr feuchtigkeitsempfindlich; Nur unter wasserfreien Bedingungen öffnen (Glovebox oder mit Argonspülung). Nach dem Öffnen unbenutztes Material sofort unter Argon auf –20 °C erwärmen.

Haltbarkeit: 2–3 Jahre bei Lagerung bei –20 °C in einem verschlossenen, inertgespülten Behälter mit Trockenmittel.

Vorsichtsmaßnahmen bei der Handhabung: In einem Abzug verwenden. Tragen Sie Nitrilhandschuhe, eine Schutzbrille und einen Laborkittel. Staubentwicklung vermeiden. Nach der Handhabung Hände waschen. Vollständige Sicherheitsinformationen finden Sie im Sicherheitsdatenblatt.

Produktvorteile

1. 5-Methylcytosin für verbesserte Duplexstabilität und Nukleaseresistenz

Die 5-Methylgruppe an der Cytosinbase erhöht die Schmelztemperatur (Tm) von DNA/DNA- und DNA/RNA-Duplexen um etwa 0,5–1,0 °C pro Modifikation. Diese thermische Stabilisierung ist besonders wertvoll bei Antisense-Oligonukleotiden, bei denen eine höhere Bindungsaffinität zu einer verbesserten Wirksamkeit und einer geringeren erforderlichen Dosis führt. Die Methylgruppe verleiht außerdem eine erhöhte Resistenz gegenüber bestimmten Nukleasen.

2. Reduzierte Immunstimulation von CpG-Motiven

Unmethylierte CpG-Dinukleotide werden vom Toll-like-Rezeptor 9 (TLR9) in menschlichen Immunzellen erkannt, was zu unerwünschten immunstimulierenden Wirkungen führt. Durch den Einbau von 5-Methylcytosin in CpG-Motive (Umwandlung von CpG in 5-meCpG) wird die TLR9-Erkennung aufgehoben, wodurch die Freisetzung von Zytokinen außerhalb des Ziels bei Antisense- und siRNA-Anwendungen verringert wird. 5'-O-(4,4'-DiMethoxytrityl)-N4-benzoyl-2'-desoxy-5-Methylcytidin-3'-O-(O-2-cyanoethyl-N,N-diisopropylaMino) phosphoramidit ermöglicht diese entscheidende Immunmodulation.

3. Vollständige Kompatibilität mit der Standard-DNA-Synthese und -Entschützung

5'-O-(4,4'-DiMethoxytrityl)-N4-benzoyl-2'-desoxy-5-Methylcytidin-3'-O-(O-2-cyanoethyl-N,N-diisopropylaMino)-Phosphoramidit verwendet das gleiche Schutzgruppenschema wie Standard-2′-Desoxycytidin-Phosphoramidit (DMT bei 5′, Bz bei N4, CE bei 3′), mit dem einzigen Unterschied 5-Methyl-Substituent. Daher sind keine Änderungen an Synthesezyklen, Aktivatorlösungen oder Entschützungsbedingungen erforderlich – es funktioniert nahtlos auf allen Standard-DNA-Synthesizern.

4. Unverzichtbar für CpG-Inselmethylierungsstudien

In der epigenetischen Forschung werden Oligonukleotide mit definierten 5-Methylcytosin-Mustern als Substrate für Methyltransferasen, als Standards für die Bisulfit-Sequenzierung und als Sonden für Methyl-bindende Proteine ​​verwendet. 5'-O-(4,4'-DiMethoxytrityl)-N4-benzoyl-2'-desoxy-5-Methylcytidin-3'-O-(O-2-cyanoethyl-N,N-diisopropylaMino) phosphoramidit ermöglicht Forschern die Synthese individuell methylierter DNA-Sequenzen ohne enzymatische Methylierung, die oft zu unvollständigen oder heterogenen Mustern führt.

5. Antisense-Oligonukleotid-Therapeutika

Mehrere von der FDA zugelassene Antisense-Medikamente (z. B. Nusinersen, Inotersen) enthalten 5-Methylcytosinreste, um die Stabilität zu erhöhen und die Immunogenität zu verringern. 5'-O-(4,4'-DiMethoxytrityl)-N4-benzoyl-2'-desoxy-5-Methylcytidin-3'-O-(O-2-cyanoethyl-N,N-diisopropylamino)phosphoramidit ist das Monomer der Wahl für die Herstellung solcher Therapeutika im kommerziellen Maßstab.

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