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Fmoc-beta-Ala-OH (Fmoc-β-alanin, 3-((((9H-Fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)propansäure, CAS 35737-10-1) ist ein Fmoc-geschütztes β-Aminosäurederivat mit der an die β-Aminogruppe gebundenen Fmoc-Schutzgruppe (9-Fluorenylmethyloxycarbonyl). Im Gegensatz zu Standard-α-Aminosäuren enthält Fmoc-beta-Ala-OH die Aminogruppe in der β-Position (Kohlenstoff 3) relativ zur Carbonsäure, was zu einem Rückgrat aus drei Kohlenstoffatomen (H₂N-CH₂-CH₂-COOH) anstelle des Rückgrats aus zwei Kohlenstoffatomen von α-Alanin führt.

Fmoc-Gln(Trt)-OH (Nα-Fmoc-Nδ-trityl-L-glutamin, CAS 132327-80-1) ist ein doppelt geschütztes L-Glutamin-Derivat mit der Fmoc-Schutzgruppe (9-Fluorenylmethyloxycarbonyl) an der Nα-Aminogruppe und der Trityl-Schutzgruppe (Trt, Triphenylmethyl) am Nδ-Seitenkettenamid. Diese einzigartige Strategie mit doppeltem Schutz geht effektiv auf die inhärenten Herausforderungen des Glutamin-Einbaus in die Peptidsynthese ein.

Fmoc-7-Me-Trp-OH (N-Fmoc-7-methyl-L-tryptophan, CAS 1808268-53-2) ist ein Fmoc-geschütztes, nicht proteinogenes Aminosäurederivat mit einer 7-Methyl-Substitution am Indolring von L-Tryptophan. Die Molekülstruktur besteht aus der Fluorenylmethyloxycarbonyl (Fmoc)-Schutzgruppe, die über eine Carbamatbindung an die α-Aminogruppe gebunden ist, mit einem 7-Methyl-L-Tryptophan-Kern, der am C-Terminus eine Carbonsäure trägt.

Fmoc-Glu(OtBu)-OH·H₂O (Fmoc-L-Glutaminsäure-γ-tert-butylester-Monohydrat, CAS 204251-24-1) ist ein Fmoc-geschütztes Derivat von L-Glutaminsäure, bei dem die γ-Carboxylgruppe der Seitenkette als tert-Butylester geschützt ist. Das Molekül verfügt über die Fmoc-Gruppe (9-Fluorenylmethyloxycarbonyl) am N-Terminus zum vorübergehenden Schutz während SPPS, eine freie α-Carbonsäure zur Peptidkettenverlängerung und einen tert-Butylester (OtBu), der das Seitenkettencarboxylat schützt.

Fmoc-L-Pen(Acm)-OH (Fmoc-S-acetamidomethyl-L-penicillamin, CAS 201531-76-2) ist ein Fmoc-geschütztes Derivat der nichtnatürlichen Aminosäure L-Penicillamin (β,β-Dimethylcystein). Das Molekül verfügt über einen Penicillamin-Kern mit einer tert-Butyl-Substitution (gem-Dimethyl) am β-Kohlenstoff, eine freie Carbonsäure und eine N-terminale Fmoc-Schutzgruppe (9-Fluorenylmethyloxycarbonyl). Die Thiolgruppe von Penicillamin ist durch eine Acetamidomethylgruppe (Acm) geschützt, die als Thiolschutzeinheit dient, die unter Standard-Fmoc-SPPS-Bedingungen stabil ist und selektiv mit Quecksilberacetat oder Jod entfernt werden kann, um das freie Thiol für die Bildung von Disulfidbindungen freizugeben.

Fmoc-ThpGly-OH (Fmoc-4-amino-tetrahydropyran-4-carbonsäure, CAS 285996-72-7) ist eine spezielle Fmoc-geschützte nichtnatürliche Aminosäure mit einem Tetrahydropyranring, der an das Alpha-Kohlenstoffzentrum kondensiert ist. Das Molekül besteht aus einem starren sechsgliedrigen Tetrahydropyran-(Oxan-)Ring mit einer Aminogruppe an der 4-Position, die durch die Fmoc-Gruppe (9-Fluorenylmethyloxycarbonyl) geschützt ist, und einer Carbonsäurefunktion am gleichen Kohlenstoff.