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Fmoc-D-Tyr(Et)-OH (N-[(9H-fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl]-O-ethyl-D-tyrosin; C26H25NO5; MW 431,49 g/mol) ist ein N-α-Fmoc-geschütztes, O-ethyliertes Derivat der nicht-natürlichen D-Tyrosin-Aminosäure. Die Molekülarchitektur besteht aus einem Fluorenylmethoxycarbonylcarbamat, das die α-Aminogruppe schützt, einem freien Carbonsäureterminus für die Bildung von Amidbindungen und einer p-Ethoxybenzylseitenkette, in der das phenolische –OH von Tyrosin zum Ethylether (–OEt) alkyliert wurde.

Fmoc-Val-OH (N-[(9H-fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl]-L-valin; C20H21NO4; MW 339,39 g/mol) ist ein N-α-Fmoc-geschütztes Derivat der verzweigtkettigen Aminosäure L-Valin. Die Molekülstruktur besteht aus einem Fluorenylmethoxycarbonylcarbamat, das an die α-Aminogruppe von L-Valin gebunden ist, mit einem freien Carbonsäureterminus, der für die Bildung einer Amidbindung verfügbar ist.

Fmoc-Leu-OH (N-[(9H-fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl]-L-leucin; C21H23NO4; MW 353,42 g/mol) ist ein N-α-Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) geschütztes Derivat der essentiellen verzweigtkettigen Aminosäure L-Leucin. Die Molekülarchitektur besteht aus einem Fluorenylmethoxycarbonylcarbamat, das an die α-Aminogruppe von L-Leucin gebunden ist, während der Carbonsäureterminus für die anschließende Bildung einer Amidbindung frei bleibt.

Fmoc-Glu-OAll (N-α-Fmoc-L-Glutaminsäure-α-allylester, IUPAC: (4S)-4-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-5-oxo-5-prop-2-enoxypentansäure) ist ein orthogonal geschütztes Glutaminsäurederivat, das eine basenlabile Fmoc-Gruppe am α-Aminoterminus und einen schützenden Allylester (OAll) trägt die α-Carboxylgruppe, während die Seitenkette γ-Carboxyl eine freie Carbonsäure bleibt.

Fmoc-Asp(OAll)-OH (N-α-Fmoc-L-Asparaginsäure-α-allylester, IUPAC: (2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-4-oxo-4-prop-2-enoxybutansäure) ist ein orthogonal geschütztes Asparaginsäurederivat mit zwei unterschiedlichen Schutzstrategien: einer basenlabilen Fmoc (9-Fluorenylmethoxycarbonyl)-Gruppe zum Schutz des α-Aminoterminus und ein Allylester (OAll) zum Schutz der α-Carboxylgruppe.

Fmoc-D-Ser(tBu)-OH (N-[(9H-fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl]-O-tert-butyl-D-serin) ist ein N-Fmoc-geschütztes, O-tert-Butyl-geschütztes Derivat der nichtnatürlichen Aminosäure D-Serin. Die Struktur besteht aus einer 9-Fluorenylmethyloxycarbonylgruppe (Fmoc), die an die α-Aminogruppe gebunden ist, und einer säurelabilen tert-Butylethergruppe (tBu), die die Hydroxylgruppe der Seitenkette schützt. Dieses orthogonale Schutzschema – basenlabiles Fmoc am Amin, säurelabiles tBu an der Seitenkette – ist von grundlegender Bedeutung für seine Rolle bei der Fmoc-Festphasenpeptidsynthese (SPPS).