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C13-112-Tetra-Schwanz (CAS 1381861-92-2) ist ein ionisierbares kationisches Lipidmolekül, das durch eine einzigartige molekulare Architektur gekennzeichnet ist, die eine polare Aminoalkohol-Kopfgruppe, vier hydrophobe Kohlenstoff-13-Schwänze und einen PEG2-Linker kombiniert. Das Lipid verfügt über einen zentralen tertiären Aminkern, von dem sich vier Tridecylketten (C13) erstrecken, die jeweils in einer primären Hydroxylgruppe enden. Strukturell besteht der C13-112-Tetraschwanz aus zwei Aminoalkoholeinheiten, die über einen PEG2-Spacer (Diethylenglykol) verbunden sind, was zu einer symmetrischen Mehrschwanzkonfiguration führt, die das hydrophobe Volumen maximiert und gleichzeitig die Amphiphilie für eine effektive Bildung von Lipid-Nanopartikeln (LNP) beibehält.

1-[2,3-Bis[(9Z,12Z)-octadeca-9,12-dien-1-yloxy]propyl]pyrrolidin, auch bekannt als A-066, ist ein kationisches Lipid mit einer Pyrrolidin-Kopfgruppe, die an ein Glycerin-Rückgrat gebunden ist, das mit zwei Linoleyl-Kohlenwasserstoffschwänzen (C18:2, Δ9,12) dietherisiert ist. Strukturell besteht das Molekül aus einem zentralen chiralen Glycerin-Gerüst mit zwei ungesättigten Fettalkoholketten (jede enthält zwei cis-Doppelbindungen), die über Etherbindungen verbunden sind und in einem tertiären Pyrrolidinamin enden. Das Vorhandensein der Pyrrolidin-Kopfgruppe unterscheidet 1-[2,3-Bis[(9Z,12Z)-octadeca-9,12-dien-1-yloxy]propyl]pyrrolidin vom strukturell verwandten DODMA, das über eine Dimethylamino-Kopfgruppe verfügt.

Das Produkt ist 2'-F-Ac-dC Phosphoramidit (5'-O-(4,4'-Dimethoxytrityl)-2'-fluor-2'-desoxycytidin-3'-O-[(2-cyanoethyl)-(N,N-diisopropyl)]-phosphoramidit). Da es sich um ein spezialisiertes Phosphoramidit-Monomer handelt, weist seine Kernstruktur eine 2'-Desoxycytidin-Zuckereinheit mit einem Fluoratom an der 2'-Position und einer Acetyl (Ac)-Schutzgruppe an der Cytosinbase auf. Diese einzigartige 2'-Fluor-Modifikation beeinflusst tiefgreifend die Zucker-Pucker-Konformation und fixiert den Ribosering in einer C3'-endo (RNA-ähnlichen) Konformation. Diese vororganisierte Struktur erhöht die Nukleaseresistenz des resultierenden Oligonukleotids erheblich und erhöht seine Bindungsaffinität zu komplementären RNA-Zielen. 2'-F-Ac-dC Phosphoramidit ist daher nicht nur ein Baustein; Es ist der Schlüssel zur Erzeugung chemisch stabilisierter, hochaffiner Antisense-Oligonukleotide (ASOs), siRNAs und Aptamere.

2'-F-dU Phosphoramidit (auch bekannt als DMT-2′-F-dU Phosphoramidit, CAS 146954-75-8) ist ein chemisch modifiziertes Desoxyuridin-Phosphoramidit-Monomer mit einer 2′-Fluor-Substitution (2′-F) am Desoxyribose-Zucker, einer 5′-O-Dimethoxytrityl (DMT)-Schutzgruppe und einem β-Cyanoethyl (CE)-Phosphoramidit 3′-Position. Die Uridinbase ist ohne exozyklische Aminschutzgruppe vorhanden (im Gegensatz zu Cytidin oder Adenosin), was die Synthese und Entschützung von Oligonukleotiden, die diese Modifikation enthalten, vereinfacht. Die 2′-Fluor-Modifikation ist eine der wirksamsten chemischen Modifikationen zur Verbesserung der Nukleaseresistenz und thermischen Stabilität in Oligonukleotidtherapeutika. Das stark elektronegative Fluoratom an der 2′-Position fixiert den Zucker in einer C3′-endo (RNA-ähnlichen) Konformation, die das Oligonukleotid-Rückgrat für eine feste Bindung an komplementäre RNA-Ziele vororganisiert. 2'-F-dU-Phosphoramidit wird häufig bei der Synthese von siRNA, Antisense-Oligonukleotiden (ASOs) und Aptameren verwendet, insbesondere wenn eine Thymin-ähnliche Base benötigt wird, aber eine erhöhte Bindungsaffinität zu Adenosin aufweist.

1,2-Dioleoyl-3-trimethylammoniumpropan (Chloridsalz), allgemein als DOTAP-Chlorid bezeichnet, ist ein kationisches Lipid, das weithin für seine Rolle bei der Nukleinsäureabgabe bekannt ist. Strukturell verfügt das Molekül über eine quartäre Ammonium-Kopfgruppe, die eine permanente positive Ladung trägt, zwei 18-Kohlenstoff-Oleoylketten (C18:1), die jeweils eine cis-Doppelbindung enthalten, und ein Chlorid-Gegenion, das die Gesamtladung ausgleicht. Die ungesättigten Fettsäureschwänze führen zu Knicken in den Acylketten, wodurch die Membranflüssigkeit erhöht und die liposomale Fusion mit Zellmembranen gefördert wird. Die Chloridsalzform von 1,2-Dioleoyl-3-trimethylammoniumpropan (Chloridsalz) ist die bevorzugte Formulierung für biologische Anwendungen, da das Chlorid-Gegenion im Gegensatz zu schlecht löslichen Jodidsalzformen Wasserlöslichkeit und Kompatibilität mit physiologischen Bedingungen gewährleistet. Diese Kombination aus permanenter kationischer Ladung und flexiblen ungesättigten Schwänzen macht 1,2-Dioleoyl-3-trimethylammoniumpropan (Chloridsalz) zu einem außergewöhnlich wirksamen Baustein für die Formulierung von Liposomen und Lipid-Nanopartikeln (LNPs) für Anwendungen zur Genabgabe.

Bz-rC Phosphoramidit (auch bekannt als DMT-2′-O-TBDMS-rC(Bz) Phosphoramidit, CAS 118380-84-0) ist ein Standard-Ribonukleosid-Phosphoramidit-Monomer, das in der Festphasen-RNA-Synthese verwendet wird. Das Molekül verfügt über eine 2′-O-TBDMS (tert-Butyldimethylsilyl)-Schutzgruppe am Ribosezucker, eine N4-Benzoyl (Bz)-exozyklische Amin-Schutzgruppe an der Cytosinbase, eine 5′-O-Dimethoxytrityl (DMT)-Schutzgruppe an der 5′-Hydroxylposition und eine β-Cyanoethyl (CE)-Phosphoramidit-Funktionalität an der 3′-Position. Die N4-Benzoylgruppe ist eine der am häufigsten verwendeten Schutzstrategien für das exozyklische Cytosin-Amin und bietet einen robusten Schutz vor unerwünschten Acylierungs- und Verzweigungsreaktionen beim Aufbau der Oligonukleotidkette. Die 2′-O-TBDMS-Gruppe ist die klassische Schutzgruppe für die 2′-Hydroxylgruppe in der RNA-Synthese und bietet eine hervorragende Selektivität bei der Entschützung und Kompatibilität mit Standard-Festphasensynthesezyklen. Bz-rC-Phosphoramidit ist der Baustein der Wahl für Forscher, die einen hochpräzisen Einbau von Cytidinresten in synthetische RNA-Oligonukleotide für Anwendungen benötigen, die von der Strukturbiologie bis zu RNA-Therapeutika reichen.