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H-N-Me-Trp(Boc)-OAll Oxalat (tert-Butyl (S)-3-(3-(allyloxy)-2-(methylamino)-3-oxopropyl)-1H-indol-1-carboxylatoxalat) ist ein spezielles N-methyliertes Tryptophan-Derivat mit orthogonalem Schutz seiner drei funktionellen Gruppen. Das Molekül enthält eine Nα-Methylgruppe (H-N-Me), einen Boc-geschützten Indolstickstoff und eine Allylester-Schutzgruppe (OAll) am C-Terminus.

Boc-Val-OH (N-(tert-Butoxycarbonyl)-L-Valin) ist ein Boc-geschütztes Derivat der essentiellen verzweigtkettigen Aminosäure L-Valin. Das Molekül besteht aus einem Valinkern, dessen α-Aminogruppe durch eine tert-Butoxycarbonylgruppe (Boc) geschützt ist, während die Carbonsäure für Kopplungsreaktionen frei bleibt. Diese Schutzstrategie macht die Aminogruppe unter basischen und nukleophilen Bedingungen inert und ermöglicht gleichzeitig die selektive Entschützung unter sauren Bedingungen (typischerweise TFA).

Boc-Arg-OH·H₂O·HCl (Nα-(tert-butoxycarbonyl)-L-argininhydrochlorid-Monohydrat) ist ein geschütztes Argininderivat mit einer tert-Butoxycarbonylgruppe (Boc), die die α-Aminogruppe schützt, dargestellt als Hydrochloridsalz-Monohydrat. Das Molekül besteht aus einem L-Arginin-Rückgrat, wobei die α-Aminogruppe durch das Boc-Carbamat maskiert ist, die Guanidinium-Seitenkette intakt ist und die Carbonsäure als freie Säure vorliegt.

Boc-Cys(Acm)-OH (Boc-S-acetamidomethyl-L-cystein) ist ein doppelt geschütztes Cysteinderivat mit einer tert-Butoxycarbonylgruppe (Boc), die die α-Aminogruppe schützt, und einer Acetamidomethylgruppe (Acm), die die Thiolseitenkette schützt. Das Molekül besteht aus einem L-Cystein-Rückgrat, wobei die α-Aminogruppe durch das Boc-Carbamat maskiert ist und die Thiolfunktionalität als S-Acetamidomethylthioether geschützt ist.

Boc-4-Chloranilin (tert-Butyl-N-(4-chlorphenyl)carbamat) ist ein geschütztes Anilinderivat mit einer tert-Butoxycarbonylgruppe (Boc), die an den Stickstoff von 4-Chloranilin gebunden ist. Das Molekül besteht aus einem parachlorierten Benzolring, der mit einer Carbamateinheit verbunden ist, wobei die Boc-Gruppe als robuste Schutzgruppe für den Anilinstickstoff dient.

Boc-Gly-OH (N-tert-Butoxycarbonylglycin) ist die einfachste N-Boc-geschützte Aminosäure und verfügt über ein Glycin-Rückgrat mit einer Boc-Schutzgruppe (tert-Butoxycarbonyl), die an die α-Aminogruppe gebunden ist. Das Molekül besteht aus einem Glycinrest – der kleinsten und konformativ flexibelsten Aminosäure – wobei die Boc-Gruppe die Aminofunktionalität während der Peptidsynthese vorübergehend schützt.